生 物 多 様 性 情 報 学 I　　　　　Biodiversity Informatics I

科目番号：　G30 2001
単位数：　１単位
標準履修年次：　２・３年
実施学期　曜時限：　第1学期　水曜日　２時限
担当教員：　橋本　哲男、伊藤　　希

授業概要：
　生物多様性研究に必要となる系統進化学の方法論について、主として生体高分子の配列データ（塩基配列、アミノ酸配列）の解析法を中心に取り扱う。配列データの比較解析法の基礎となる分子進化の概念を概説した後、配列類似度解析法、複数配列アライメント法、分子系統樹法などについて講述し、これら方法論の基本概念を理解させる。

授業内容：
（１）　生物多様性の分子生物学
（２）　分子進化の基礎概念（１）
（３）　分子進化の基礎概念（２）
（４）　配列類似度解析法
（５）　配列データベース検索法
（６）　複数配列アライメント法
（７）　系統学概説
（８）　分子系統樹法（１）
（９）　分子系統樹法（２）
（１０）分子系統樹法（３）
　　授業内容は目安であり、トピックに応じて多少の変更がある。

前提科目・履修上の注意事項：
生化学概論、遺伝学概論、分類学概論の内容および高校レベルの確率・統計の内容の理解を前提とする。生物サテライト室にて随時演習を行うので、受講人数の上限を40人程度とする。

単位取得条件、成績評価基準：
演習のレポートならびに学期末試験の成績を総合評価する。

指定教科書：　なし

参考書・文献：
１）「分子進化学 ―解析の技法とその応用―」宮田隆編 (1998) 共立出版
２）「バイオインフォマティクス」David W. Mount／岡崎康司、坊農秀雅（監訳）(2002) メディカルサイエンスインターナショナル ISBN 489592307X

オフィスアワー：
特に定めない。事前連絡が望ましい。
橋本哲男：生物農林学系棟 B517 (電話6660)　E-mail: hashi@biol.tsukuba.ac.jp
伊藤　希：生物農林学系棟 B811 (電話4768)　E-mail: nozomi@biol.tsukuba.ac.jp

備考（受講学生に望むこと）：