生 物 多 様 性 情 報 学 II　　　　　Biodiversity Informatics II

科目番号：　G30 2101
単位数：　１単位
標準履修年次：　２・３年
実施学期　曜時限：　第２学期　水曜日　２時限
担当教員：　橋本　哲男、伊藤　　希

授業概要：
　生物多様性情報学 I の講義内容に引き続き、分子系統樹法のうちとくに最尤法についてさらに詳細な内容を解説する。また、生物の系統進化研究への分子系統樹法の具体的応用とその問題点について、さまざまな解析例をもとに解説する。分子系統進化学分野の最新の話題にも触れる。

授業内容：
（１）　統計学の準備
（２）　最尤法による分子系統樹の推測（１）分子進化の統計モデル
（３）　最尤法による分子系統樹の推測（２）系統樹の信頼性の評価
（４）　最尤法による分子系統樹の推測（３）複数遺伝子に基づく解析
（５）　動物の系統進化
（６）　真核生物の系統進化
（７）　生物界全体の系統進化と真核生物の起源
（８）　遺伝子水平転移の推測
（９）　比較生化学と分子系統樹法
（１０）分子系統進化学分野の最新の話題
　　授業内容は目安であり、トピックに応じて多少の変更がある。

前提科目・履修上の注意事項：
生物多様性情報学 Iの内容の理解を前提とする。生物サテライト室にて随時演習を行うので、受講人数の上限を40人程度とする。

単位取得条件、成績評価基準：
演習のレポートならびに学期末試験の成績を総合評価する。

指定教科書：　なし

参考書・文献：
１）「分子系統学」長谷川政美、岸野洋久 (1996) 岩波書店
２）「シリーズ進化学 1 マクロ進化と全生物の系統分類」佐藤矩行他 (2004) 岩波書店 ISBN 4000069217

オフィスアワー：
特に定めない。事前連絡が望ましい。
橋本哲男：生物農林学系棟 B517 (電話6660)　E-mail: hashi@biol.tsukuba.ac.jp
伊藤　希：生物農林学系棟 B811 (電話4768)　E-mail: nozomi@biol.tsukuba.ac.jp

備考（受講学生に望むこと）：