分 子 進 化 学 実 験　　　　　Molecular Evolution，Laboratory

科目番号：　G11 2703
単位数：　1.5単位
標準履修年次：　２・３年
実施学期 曜時限：　第３学期（後半）　木・金曜日　３・４・５時限
担当教員：　稲垣　祐司、橋本　哲男

授業概要：
　分子レベルで生物進化を考察する上で、解析対象の生物から特定の遺伝子データを取得することは必須である。このような未知の塩基配列決定のためには、縮重プライマーをもちいたPCR（ポリメラーゼ連鎖反応）による遺伝子増幅が用いられる。本実験では、今までに配列が決定されていない藻類葉緑体遺伝子をターゲットとし、縮重プライマーの設計とそのプライマーをもちいたPCRにより遺伝子増幅を行う。さらに増幅断片の塩基配列を決定し、目的遺伝子が増幅されているか確認する。

授業内容：
第１回　縮重プライマーの設計
第２回　縮重プライマーをもちいた葉緑体遺伝子のPCR
第３回　遺伝子増幅断片のクローニング
第４回　遺伝子増幅断片のシークエンスシング
第５回　取得した塩基配列の相同性検索
第６回
第７回
第８回
第９回
第10回

実習内容は目安であり、トピックに応じて多少の変更がある。

前提科目・履修上の注意事項：
生化学概論、遺伝学概論、分類学概論、分子進化学Iの内容の理解を前提とする。受講人数の上限を15人程度とする。

単位取得条件、成績評価基準：
出席回数、実習中の取組み、レポートの内容を総合評価する。

指定教科書： なし

参考書・文献： 必要に応じて授業時に紹介する。

オフィスアワー：
特に定めない。事前連絡が望ましい。
稲垣祐司：総合研究棟B 1206D (電話3968)　E-mail: yuji@ccs.tsukuba.ac.jp
橋本哲男：生物農林学系棟 B517 (電話6660)　E-mail: hashi@biol.tsukuba.ac.jp

備考（受講学生に望むこと）：