無縦溝亜目 Araphidineae	縦溝をもたない
縦溝亜目 Raphidineae	縦溝をもつ

無縦溝亜目Araphidineaeの科の検索

プロトラフィス科 Protoraphidaceae	殻はS字形の軸域 (axial area)をもち，両極の反対側に1列または融合した唇状突起をもつ。
ディアトマ科 Diatomaceae	殻はS字形の軸域をもたず，どちらか一方の極に一つの唇状突起をもつ。

縦溝亜目Raphidineaeの科の検索

ユーノティア科 Eunotiaceae	縦溝は短く原始的
アクナンテス科 Achnanthaceae	殻は発達した縦溝をもつ	縦溝は間板や管状構造 (canal)をもたない	片方の殻だけに縦溝がある（単縦溝珪藻）
ナビキュラ科 Naviculaceae			両方の殻に縦溝がある
アウリキュラ科 Auriculaceae		縦溝は間板や管状構造 をもつ	被殻は長軸に対して非総称で，縦溝は背側にあるが，中央部で背側に曲がる
エピテミア科 Epithemiaceae
ニッチア科 Nitzshiaceae			被殻は長軸に対して相称で，縦溝は竜骨の上にある。	縦溝は殻の縁に沿って殻端から殻端まで伸び，翼管 (alar canal)の上にはない。
スリレラ科 Surirellaceae				縦溝は突出した翼窓 (fenestra)のある翼管上にあり，殻縁に沿って殻全体をとりまくように走る。