黄金色藻として記載されていた藻類にペディネラ目 (Pedinellales)，ディクティオカ目 (Dictyochales)があります。この二つの目に属する仲間はそれぞれ次のような独自の性質をもち，さまざまな点で黄金色藻とは異なっています。しかし，これらは後に述べる共通の特徴をもっており，その特徴に基づいて黄色植物の独立した綱として認識されるようになりました。
細胞の前端に1本の鞭毛をもつ仲間で，Pedinella, Pseudopedinella, Apedinellaなどの葉緑体をもつ仲間，そしてPPteridomonas,
Actinomonasなどの葉緑体をもたない仲間が知られています。